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燃气发电机组与多功能水质检测车间之间的距离取决于多种因素，包括车间的通风、安全标准、工艺流程等要求，以及具体的场地布局和环境条件。

两者之间应保持适当的距离，以确保安全操作和通风良好，燃气发电机组产生的噪音、振动和排放物可能影响水质检测设备的准确性和稳定性，因此需要一定的防护和隔离措施，还要考虑工艺流程的顺畅性和操作人员的便利性。

具体距离应根据实际情况进行评估和设计，建议咨询相关领域的专业人士以获取更准确的建议。